Die Schule für Physiotherapie ist Teil der Gesundheitsfachschulen der Uniklinik Köln und direkt an die klinischen Einrichtungen der Universität angebunden. Hier besteht die Möglichkeit, einen Abschluss in einem staatlich anerkannten Ausbildungsberuf im Gesundheitssektor zu erwerben. Zu den Angeboten der Gesundheitsfachschulen zählen die Ausbildung in der Gesundheitspflege, Krankenpflege und Kinderkrankenpflege. Ferner werden Berufsabschlüsse im Bereich der operationstechnischen Assistenz sowie der technischen Assistenz in der Medizin angeboten.

In den Fachbereichen Physiotherapie, Massage und medizinisches Bäderwesen kann der Ausbildungsgang zum/zur Masseur/-in und Bademeister/-in belegt werden. Die Ausbildung dauert zweieinhalb Jahre und beinhaltet den Schulunterricht sowie die Praktikumszeit. Im Fachbereich Physiotherapie erfolgt die staatlich anerkannte Ausbildung zum/zur Physiotherapeut/-in. Die Ausbildung dauert drei Jahre und schließt mit dem Staatsexamen ab. Der praktische Teil der Ausbildung findet in den Abteilungen der Uniklinik sowie in nahe gelegenen Krankenhäusern und Rehabilitationseinrichtungen statt.